Folding@Home : team [DoDFr]

08/04/2006 07h01 #1 
CampyloBacteR

Commandant
Commandant


Suite à la news postée par TheJack200 à propos du projet Folding@Home pour créér le topic de la team [DoDFr] ici.

Dans ce topic, on pourra parler du projet, des problèmes techniques éventuel, de vos statistiques, bref de tout ce qui se rapporte à ce projet à travers la team [DoDFr]...

Je le repète encore une fois, n'hesitez pas à vous joindre à nous, [u]ce n'est absulument pas contraignant.[/url]

Tréve de bavardages, c'est parti !

News postée par TheJack200

Vous avez sans doute eu l'occasion d'entendre parler de calcul distribué via Internet. Le projet le plus célèbre dans le genre : SETI@Home. Il existe d'autres projets du même genre et parmis eux : Folding@home (littéralement "pliage à la maison").

Ce projet de calcul distribué, initié par un laboratoire de chimie de l'université de Stanford, a pour but d'étudier le comportement des protéines Il ne s'agit pas moins de les plier à l'aide d'un algorithme complexe. La forme des protéines est essentielle pour déterminer l'efficacité d'un médicament. Aujourd'hui la biochimie nous apprend que toutes les maladies, génétique ou non se traduisent à l'échelle cellulaire par une anomalie au niveau protéique: Défaut de conformation, défaut d'adressage, interactions qui n'a pas lieu d'être, c'est la compréhension de ses mécanismes qui est le but avoué de Folding@Home, le calcul des formes que prennent les protéines lors de leur repliement demande des capacités de calcul énormes. Le calcul distribué s'avère heureusement bien adapté à cela.
On pourrait croire que ce projet est "chapeauté" par de grosses entreprises privées. Que nenni ! Folding@Home est soutenu par une seule université publique américaine, celle de Stanford. Cette dernière n'a pas forcément beaucoup de moyens pour acheter de gros super-calculateurs, contrairement aux multi-nationales.

La transparence de ce projet est totale. Tous les résultats sont publiés gratuitement sur le site de Folding@Home, ainsi que dans les revues internationales de référence, comme Science ou Nature. D'autre part, aucun brevet n'est déposé sur ces résultats. Ce projet est d'ailleurs soutenu par des laboratoires publics français, comme le génopôle d'Evry. Voilà, vous savez à peu près tout sur Folding@Home.

Les résultats que vous calculerez auront des applications directes dans la mise au point de médicaments traitant le cancer, le sida, la maladie d'alzheimer, ou encore celle de la vache folle.

Un groupement d'internautes français l'Alliance-Francophone a été créé pour rassembler et promouvoir le projet au sein des pays francophones. Au sein de ce groupement, une multitude de "mini-équipes" se sont formées et "s'affrontent" au sein d'un classement qui met en valeur les équipes effectuant le plus de calculs.

Au niveau PC, une fois le client installé et paramétré (pas compliqué à faire), le processus de calcul utilise le %CPU qui reste disponible : quand le PC ne fait rien, le process utilise 90% des ressources processeurs, si vous lancez d'autres applications, ce % diminue. Vous pouvez (comme moi) arréter/démarrer le calculateur à la main (quand vous jouez ou autre...) donc de ce point de vue, il n'y a aucune contrainte.

Deux clients existe : un en mode fenetré (console type MS-DOS) trés léger et un autre plus beau, plus graphique puisqu'on voit la molecule en cours de traitement.

Le client peut être réglé pour envoyer automatiquement ces résultats (ou pas) et pour en télécharger de nouveaux (ou pas)...

Bref, peu de contraintes et le sentiment d'être utile aux autres.

Pour rejoindre la team DoDFrance.com rien de plus simple, il suffit de s'inscrire lors de la configuration sous la team de l'Alliance-Francophone (c'est le n° 51) et de rajouter la balise [DoDFr] dans votre nick.

Pour tout info supplémentaire on vous conseille d'aller lire la FAQ de l'Alliance Francophone.
Si vous avez des questions ou des remarques à faire, rendez-vous sur ce thread


  • Site officiel de F@H : ici
  • Site de téléchargement : ici
  • Site de l'Alliance-Francophone : ici
  • FAQ de l'Alliance-Francophone : ici
  • Stats des membres le l'Alliance-Francophone : ici ou ici


Parlez-en à votre entourage, faites passez le mot Souriant

Bon folding !

08/04/2006 07h41 #2 
CampyloBacteR

Commandant
Commandant


A quoi ressemble l'interface ?



Les infos visibles :

- le pseudo

- la team pour laquelle on bosse (51 correspond à l'Allaince Francophone. La team DoDFr est une mini team de l'AF)

- le nom de la proteïne en cours

- le nombre moyen de seconde passées pour calculer une frame

- le nombre total de frames calculées (7200/10000)

- WU End correspond à la date estimée de fin de calcul : ce soir à 17h51 (on a aussi le temps restant estimé...)

Bons pliages à tous...

J'ai hate de voir mes premières stats...
08/04/2006 08h54 #3 
D4rtagnan
[Chti-Drink]
Colonel
Colonel


Une sorte de benchmark utile
08/04/2006 12h42 #4 
TheJack200

Adjudant chef
Adjudant chef


tout ?fait :)

voici une petite liste provisoire de ceux qui participent d? au projet:

[list:9f677c148d]
[*:9f677c148d][DoDFr]epolas
[*:9f677c148d][DoDFr]TheJack200
[*:9f677c148d][DoDFr]DGDG
[*:9f677c148d][DoDFr]_Kannad
[*:9f677c148d][DoDFr]D4rtagnan
[*:9f677c148d][*:9f677c148d][DoDFr]Deftones
[*:9f677c148d]Bol_de_Riz_[DoDFr]
[*:9f677c148d][DoDFr]JS_Server
[*:9f677c148d][DoDFr]*LePaPe*
[*:9f677c148d][DoDFr]CampyLo.B
[*:9f677c148d][DoDFr]disuj


[*:9f677c148d][DoDFr]Snk
[*:9f677c148d][DoDFr]Negus
[*:9f677c148d][DoDFr]c0urg3tt3
[*:9f677c148d][DoDFr]Bhaal
[*:9f677c148d][DoDFr]kumquat

[*:9f677c148d][DoDFr]JS
[*:9f677c148d][DoDFr]_Deserteur
[*:9f677c148d]TheJack200
[*:9f677c148d][DoDFr]loom
[*:9f677c148d][DoDFr]Pacos
[*:9f677c148d][DoDFr]Rc
[*:9f677c148d][DoDFr]smAcks
[*:9f677c148d][DoDFr]Fiz0r


[/list:u:9f677c148d]

Postez un message si vous venez de commencer, ou que vous etes d? occup?vec le nick exact que vous employer pour 'plier', on vous rajoutera ?a liste.

Voici un site de stats bien d?ill?ui est mise a jour tout les 3 heures environ (en haut a gauche il ya un compteur qui montre le temps restant avant la prochaine update) et qui donne non seulement des graphiques/tableau a propos des performance de la team (ici dans l'exemple l'Alliance-Francophone) mais aussi des membres de la team! c'est tr?int?ssant pour suivre l'evolution et le future de certain membres/team.

Quelque chiffre a propos de l'Alliance-Francophone:
[list:9f677c148d]
[*:9f677c148d]Il y a en tout 10,287 membres inscrit, et dont (seulement) 11% qui sont actif a ce jour, c?environs 1163 membres.

[*:9f677c148d]l'AF est sur la 4i? position du classement mondiale des teams (cfr ici)
[/list:u:9f677c148d]
Si vous avez des remarques, suggestions, commentaires a faire a propos de ce projet, n'hesitez pas, vous ?s au bon endroit ! Grand Sourire
10/04/2006 05h15 #5 
CampyloBacteR

Commandant
Commandant


Ca y 'est, j'ai fini mon premier calcul dans la nuit... Place à la p2095_Protein.

:)
10/04/2006 11h21 #6 
TheJack200

Adjudant chef
Adjudant chef


h?, gg Souriant
l?je suis occup?ur la p2107, je ne l'aurais pas fini avant jeudi matin...

Hier j'ai jou? DoD avec mon Folding encore allum?t j'ai eu aucun probl? de ping/lag & co, tout marche normallement Souriant
10/04/2006 12h10 #7 
CampyloBacteR

Commandant
Commandant


TheJack200 a écrit:héhé, gg Souriant
Hier j'ai joué a DoD avec mon Folding encore allumé et j'ai eu aucun problème de ping/lag & co, tout marche normallement Souriant


Je testerai dès que possible...
10/04/2006 13h16 #8 
Kannad
No Reflection
Major
Major


Chez moi ça me provoque quelques retours windows intempestif donc je l'arrête pendant les matchs mais niveaux réseaux et systèmes, c'est nickel pas de lag et ça ne rame pas.

Moi c'est [DoDFr]_Kannad.
10/04/2006 21h30 #9 
TheJack200

Adjudant chef
Adjudant chef


Pour avoire un match dans des conditions optimis?'est en effet peut-etre mieux de le desactiver durant cette p?ode :)

J'ai cr?un topic dans le forum de l'Alliance-francophone afin de nous pr?nter au reste de cette team,
allez poster un msg pour faire un coucou, ils ne vous morderont pas ;)

=> c'est par
11/04/2006 16h00 #10 
TheJack200

Adjudant chef
Adjudant chef


Cool
11/04/2006 21h55 #11 
Snk
mysTix !
Général de division
Général de division


Je suis inscrit => [DoDFr]Snk

Bon niveau activité j'ai fait tourner une vingtaine d'heures et les stats donnent rien jcapte pas trop :/
11/04/2006 22h01 #12 
TheJack200

Adjudant chef
Adjudant chef


Tu sera affiché dans les stats seulement quand t’aurai fini un WU (work-unit) au complet, ça peut prendre un certain temps, et les stats sur le site officiel sont mise a jours tout les 2 à 3 heures environs, il faut avoir un peu de patience Souriant le mieux est de verifier les stats officiels 2 ou 3 heures après que t'as fini ton WU,
alors tu devrais apparaitre ici =>
pour arriver a cette page va ici puis selectionne Starts with puis tu note [DoDFr] dans la case

Le temps aproximative qu'il te reste est affiché en bas a gauche dans la fenetre du prog Folding@Home (cfr screen de Campy) ca te donnera une idée du temps restant, même si ce n'est pas a 100% precis,

Mais le principale est de participer, les stats sont juste là pour avoir une idée intéressante d'ou en est la team et les users Souriant
12/04/2006 17h32 #13 
DGDG

2ème classe
2ème classe


Ca roule -> [DoDFr]DGDG
13/04/2006 12h46 #14 
CampyloBacteR

Commandant
Commandant


Bon, j'espère finir ma deuxième protëine d'ici Samedi...
13/04/2006 19h24 #15 
TheJack200

Adjudant chef
Adjudant chef


Normalement je termine ma prochaine protéine la nuit de vendredi a samedi? Souriant

On commence a avoir une sérieuse petite équipe,
souhaitons la bienvenue à Snk, Kannad, DGDG, Bol_de_Riz & loom Grand Sourire
14/04/2006 00h51 #16 
TheJack200

Adjudant chef
Adjudant chef


Me suis amusé a faire une petite bannière Tire la langue (1ière fois que j'utilise ce programme (Jasc Paint Shop Pro 9) donc /Mode mediocre ON ) :p

==> [list:621a747a75][*:621a747a75]

si cela vous semble correcte et que vous voulez l'utiliser dans un forum, voici le code :
Code:
[noparse][url=http://www.dodfrance.com/forums/showthread.php?t=9373][img]http://pix.nofrag.com/ca/5d/32bb7f14016a6320671af6f08956.psd[/img][/url][/noparse]


[*:621a747a75]
Code:
[noparse][url=http://www.dodfrance.com/forums/showthread.php?t=9373][img]http://pix.nofrag.com/e3/40/2e0955de12ecabf41faf90cb094f.psd[/img][/url][/noparse]

[/list:u:621a747a75]
14/04/2006 09h26 #17 
CampyloBacteR

Commandant
Commandant


bonne idée TheJack...

Je pense que je ferai une news sur le site de la BL dans quelques jours avec...


PS : pour ne pas être embeté lorsque tu donnes du BBCode fait précéder le code par [noparse][noparse] et termine le par [/noparse][/noparse]
14/04/2006 13h32 #18 
TheJack200

Adjudant chef
Adjudant chef


Je vais essayer d’en faire d’autres un peu mieux :)

Merci pour le noparse, j'ai modifié :p

S'il y en a qui sont tenté a faire mieux (ce qui ne dois pas être très dur...) n'hésitez pas Grand Sourire
14/04/2006 20h31 #19 
Rc!

2ème classe
2ème classe


Inscrit -> [DoDFr]Rc
15/04/2006 06h22 #20 
CampyloBacteR

Commandant
Commandant


et hop j'attaque ma 3e protéine... Bonne continuation à tous...

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